实验杂记

Posted by XiLock on November 26, 2019
  1. 专注于一点·慢慢谨慎的做事·彻底地完成
  2. 是日已过,命亦随减,如少水鱼,斯有何乐!当勤精进,如救头燃,但念无常,慎勿放逸!
  3. 心包太虚,量周沙界。
  4. 动静不失其时。
  5. 正位凝命,旷怀笃行。
  6. 夕惕若厉。
  7. 心无所住,一期一会。
  8. 克己·慎独。
  9. 行云流水,任意所致。
  10. 十力·精诚。
  11. 炼器于身。
  12. 学以聚之,问以辨之,宽以居之,仁以行之。

Buffer

piranha清洗液
Type Ratio Temp Time
Acid H2SO4 : H2O2(30%) = 7:3 60-90 C 10-30 mins
Alkali H2O: NH3·H2O: H2O2(30%) = 5:1:1 60 C(or 75C ) 10-15 mins
10mM PBS配方

按下表配方于1L水中溶解定容,用0.22um的水膜抽滤,pH大概7.31左右,接近理论值7.4:

Material(MW) Weight Mol mass
Na2HPO4(141.96) 1.44g 10.1mM
or Na2HPO4·12H2O(358.14) 3.63g 10.1mM
KH2PO4(136.09) 0.27g 1.98mM
NaCl(58.44) 8g 136.89mM
KCl 0.2g  
10mM HBS配方(受多价盐影响小)

按下表配方于1L水中溶解定容,用0.22um的水膜抽滤,pH大概5.5,需加NaOH调pH:

Material(MW) Mol mass Weight
HEPES(238.30) 0.01M 2.383g
NaCl(58.44) 0.15M 8.766g
其它常见缓冲液
  1. MES
  2. MOPE(易受多价盐影响)

常用药品

  1. 正常人血清:SoLarbio,5mM,Lot.No.20160912.Cat.No.Sl010
  2. CaCl2·2H2O(MW=147.02):100mM=14.70mg/ml(无规则水合结构)
  3. MgCl2·6H2O(MW=203.30):100mM=20.33mg/ml(六配位八面体水合结构)

仪器

纳米粒度及zeta电位分析仪
  1. 如果样品尺寸分布比较广,则可用激光衍射法
  2. 散射光强可以向数量百分比或体积百分比换算(分散剂必须准)。
  3. 溶质的折光指数和吸收率对折算重要,若不折算则不重要。
  4. 测试过程中光强误差应在5%以内。
  5. 测zeta电位的过程中,单项模式加电压的时间比较短,常规模式加电压的时间长一些。
  6. zeta potential的绝对值大于30mV被业界认为是稳定。
  7. correlation function图的纵坐标截点值应在0.8-1之间。

经验

  1. cystein会形成二硫键,导致无法吸附,所以在配置溶液时会有一步还原,加入DDT然后过柱子,或者加tris(1-carboxyethyl)phosohine hydrochloride (TCEP, 10mM, MW=286.65)。后者不用过柱子,但需要现配现用且避光混合1h。
  2. 组装时加0.5M的盐可以有效屏蔽掉electrostatic interaction,要不可能有些肽因为electrostatic interaction而难溶。
  3. 络合常数可以与结合能(用ITC测)互相换算,低pH下络合常数通常很低,常pH下络合常数则较高。
  4. pI小于pH带负电,如PBS中BSA,pI大于pH带正电,如PBS中lysozyme。

有用的链接

  1. 仪器表征基础知识汇总帖


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