《斤竹精舍·游艺集》 LAMMPS 2020

LAMMPS 重跑rerun

Posted by XiLock on October 24, 2020

`rerun`

代码示例

因为lammps的rerun不支持xyz格式的轨迹（步数读取有问题），所以可dump出lammpstrj格式，然后把原IN文件中dump部分和run这两部分注释掉后，加一个rerun之前生成的lammpstrj文件的命令即可，像下面的示例代码：

#dump myDump all custom ${Num_dump} ${O_Dir}/${OF_basename}.lammpstrj id mol element xu yu zu
#dump_modify myDump element C C C O O C N C C O N O H H H
#dump_modify myDump sort id

#run ${Num_step}
rerun ${O_Dir}/${OF_basename}.lammpstrj dump x y z

参考资料

rerun command

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