gmx 电场

Posted by XiLock on November 27, 2020

电场

恒定电场

对于最基础的长方体模拟盒子,在某一个方向上(x或y或z)施加一个恒定强度的电场,只需要在mdp文件中添加下面一行:

E-z  =  1  1.8  0

其中E-z表示在z方向上加电场;等号右边第一个数是余弦的数目,因为只实现了单个余弦项(频率为0),因此为1,不能写成1.0;第二个数为电场大小和方向,单位为V/nm,正数表示从z=0到z=max,负数则相反。

余弦电场
高斯脉冲电场
方波

没法加方波

参考资料

  1. GROMACS电场的使用
  2. 加电场模拟
  3. gromacs加正弦交流电场或者方波电场问题
  4. gmx manual 5.1 : Electric fields
  5. gmx 2019 Reference manual: Electric fields


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