Polymatic 的安装
polymatic基于perl语言，因为Linux自带perl语言，所以直接从网站上下载下来就能用。需要注意的是要加上Polymatic.pm的路径，通过polym.pl等文件里的use lib指令：
use lib '/path/to/polymatic/module';
改为
use lib '/THFS/home/huse_fx/Desktop/polymatic_v1.1';
使用
参见Manual
type文件
- type文件的格式和内容在manual和example里都有，但是要如何获取是一个问题。注意用msi2lmp生成data文件时不要加
-o，否则不会输出原子类型、成键类型等type。之前xilock尝试过msi2lmp时加-o然后用topotool重命名原子名称和类型的方式，但发现retype之后成键类型的编号变了，跟原来不一致，没法直接调用原来的coeffs，很是蛋疼！当时最后还是手撕type文件。所以记住不要乱加-o - 因为生成新的成键需要在原有成键基础上定义新的成键、角度、二面角等，如果二面角参数太多但不重要，在pl文件里将二面角相关部分注释掉来临时通过以便测试。
问题
Can’t located XML/Simple.pm in @INC…
把XML目录拷贝到家目录下的perl5/lib/perl5下就行了？（实测是拷到提示的路径，比如将XML拷贝到上面use lib指向的路径里）。
参考资料
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