直接用molclus结合gentor就能方便地对过渡态做构象搜索 molclus计算前把涉及反应区域的原子序号写进settings.ini里的freeze里令其在优化时保持冻结即可,对于调用xtb的情况也生效。
sob在萃取体系溶剂化自由能求助提到,要注意复合物可能有很多种构型,计算时应当选取能量最低的。可以用genmer+molclus做构型搜索来实现,看下面的介绍和实例。其中对于弱相互作用计算级别的正当选用也有充分体现
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直接用molclus结合gentor就能方便地对过渡态做构象搜索 molclus计算前把涉及反应区域的原子序号写进settings.ini里的freeze里令其在优化时保持冻结即可,对于调用xtb的情况也生效。
sob在萃取体系溶剂化自由能求助提到,要注意复合物可能有很多种构型,计算时应当选取能量最低的。可以用genmer+molclus做构型搜索来实现,看下面的介绍和实例。其中对于弱相互作用计算级别的正当选用也有充分体现
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