泛函选择
- 简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
- 谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
- 坚持使用B3LYP算有机体系的人的下场:用M06-2X算有机体系极为推荐,B3LYP算有机体系早该淘汰了;鼓励使用def或def2基组代替尺寸相近的Pople基组。
- B3LYP-gCP-D3BJ在Gaussian 09中的关键字
基组选择
- 对几何优化和振动分析不需要大基组,比如def2-SVP一般就够满足需要了,除非精度要求颇高,但是这绝对不意味着可以偷工减料到使用连重原子的极化都没有的6-31G之流。还要注意的是,不同体系对基组的敏感性是有差异的,比如优化过渡金属的配位键键长,def2-SVP和def2-TZVP的结果差异往往挺明显。
- 对于一般问题没有必要给氢加极化,但是和氢有密切相关的问题则应当给氢加极化。
- 由于给氢加p极化对耗时增加其实不算太多(相对于给重原子增加高角动量极化函数而言),因此有必要给氢加p极化时不要吝啬,即起码用def2-SVP或6-31G**这个档。再看超恶心的连重原子的极化都没有的6-31G,误差比def2-SV(P)又明显进一步增大,键能误差已经快100kJ/mol了。
-
对比def-TZVP和def2-TZVP的结果,虽然后者比前者昂贵很多(很大程度上是因为对F加了f极化所致),但是各方面精度都差不太多,因此def2-TZVP无福消受时用def-TZVP是很好选择。
- 谈谈量子化学中基组的选择
- 浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组
- 谈谈赝势基组的选用
- 使用Gaussian做镧系金属配合物的量子化学计算
- 计算化学键键能时考虑BSSE不仅是多余的甚至是有害的
典型case
RESP电荷拟合
- 结构优化:B3LYP-D3(BJ)/def2-SVP
- 单点:B3LYP-D3(BJ)/def2-TZVP
- 参考资料:计算RESP原子电荷的超级懒人脚本
200个阴离子体系弱相互作用计算
- opt freq: B3LYP-D3(BJ)/6-31G,带显著负电荷6-31+G
- 单点: B3LYP-D3(BJ)/6-31+G**结合counterpoise
过渡金属
- 根据我以前的一些计算,对于优化的目的,def2-SVP描述一些过渡金属配合物的配位键键长比起用SDD(Gaussian自带的版本)误差明显更大,所以我一般不推荐def2-SVP级别描述过渡金属,哪怕是opt freq阶段。另外,def2-SVP对于个别有机体系优化得有点问题,比如优化N,N-2甲基苯胺结果是平的(本该是弯的)。所以如果不嫌写输入文件略微麻烦点,用SDD结合6-31G是更好的选择(要更好点结果可以配体用6-311G。有特殊必要的话再加氢的极化)
- 参考资料:请问大家过渡金属复合物体系几何优化的基组选择
咨询别人推荐的理论方法和基组时要提供的信息
- 用什么程序计算? 算什么问题?
- 要求的精度多高?能接受多长时间耗时?计算资源如何?(CPU核数)
- 算什么类型体系?有多少原子?有什么元素?
手机版“神探玺洛克”请扫码