神探玺洛克的厨房


如果有天堂,一定是一半厨房,一半书房,然后在书房里还有一张床。

Nice cook, nice book, nice food, nice mood. One bed, no bad

------XiLock


SOME WORKS IS LIKE A FROG, YOU WON'T WANT TO EAT IT AS IT'S DISGUSTING.

THE BIGGEST TROUBLE IS SOLVED ONCE YOU EAT IT IN THE MORNING.

IF IT'S YOUR JOB TO EAT TWO FROGS, EAT THE BIGGEST ONE FIRST.

MS 使用札记

轨迹处理:xtd–>xyz 参见将Material Studio的xtd轨迹文件导出为xyz轨迹文件的方法,注意,使用时轨迹文件名不能有空格。 一些资料 Modules tutorals (Materials studio 2017) 杨老师:《MS入门手册》 Materials Studio 培训教程 创腾科技有限公司

Mopac

安装 安装-Win 把下载到的程序压缩包解压到C:\Program Files里,并且把目录名改为MOPAC。进入此目录,选中license文件。然后右键点它选“打开”,并指定用MOPAC2012.exe来打开,并且把MOPAC2012.exe设定为默认的打开.mop文件的程序。然后在MOPAC2012的程序窗口里选中Graphic1窗口,敲几下回车,然后把白色窗口的滚动条拉到最下面,如果...

gmx 力场

AMBER、GROMOS、OPLS、CHARMM最新版本的GROMACS力场包 AMBER、GROMOS、OPLS、CHARMM最新版本的GROMACS力场包 MolMod database force fields for low-molecular fluids, consisting of Lennard-Jones 12-6 interaction sites, poin...

Gaussian使用笔记 过渡态 IRC 自旋极化单重态

过渡态 方法 一般是用opt(TS,calcfc,noeigen)加freq作关键词; 只要初猜结构和实际过渡态比较接近,而且计算级别和模型合理,一般都能收敛到实际过渡态; 一般不要用QST2和QST3; 找过渡态和优化极小点一样,不需要用到太昂贵的计算级别; 优化过渡态的时候最好就带着隐式溶剂模型,因为有的时候可能有定性影响; 实对于大部分有机反应(也有很多例外)...

QCM

说明 谐振频率f QCM芯片由夹在一对电极之间的薄石英片组成。通过施加交流电压,芯片可以被激发,以特有的共振频率振荡。共振频率取决于芯片和芯片表面粘附层的总质量,其中也包括耦合水。当薄膜吸附到芯片上时,共振频率会降低。如果吸附膜薄而坚硬,频率的下降与吸附膜的质量成正比。 在这种情况下QCM得到的数据非常精准。与其他QCM不同的是,QCM-D同时监测自由振荡的芯片的频率和能量耗散响应,从...

2021-每周补脑7th

科研 言论 小的、渐进式的创新可以使行业主导企业保持领先地位,但是激进的创新可以使新公司超越行业主导企业,这就叫”跨越式发展”。– Wikipedia 相互轻蔑却又彼此来往,并一起自我作贱——这就是世上所谓“朋友”的真面目。–太宰治 胆小鬼连幸福都会害怕,碰到棉花都会受伤,有时还被幸福所伤。–太宰治 日日重复同样的事,遵循着与昨日相同的惯例,若能避开猛烈的狂喜 ,自然也不...

Knowledge 材料拉伸

参考资料 拉伸曲线分析你不得不知的窍门

MolClus

直接用molclus结合gentor就能方便地对过渡态做构象搜索 molclus计算前把涉及反应区域的原子序号写进settings.ini里的freeze里令其在优化时保持冻结即可,对于调用xtb的情况也生效。 gentor:扫描方式做分子构象搜索的便捷工具 使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索 使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdes...

2021-每周补脑6th

科研 The US can reach 90 percent clean electricity by 2035, dependably and without increasing consumer bills Microbiologists Discover Bacteria That Feed on Metal, Ending a Century-Long Search ...

Gaussian 结合MultiWFN来ESP绘制

参考阅读: 使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图 使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布 画图脚本 本脚本修改自sob老师的multiwfn附件,此处为方便使用拎出: 使用MultiWFN做完定量分子表面分析(Quantitative analysis of molecuar surface–>start ...