神探玺洛克的厨房

如果有天堂，一定是一半厨房，一半书房，然后在书房里还有一张床。

Nice cook, nice book, nice food, nice mood. One bed, no bad

------XiLock

SOME WORKS IS LIKE A FROG, YOU WON'T WANT TO EAT IT AS IT'S DISGUSTING.

THE BIGGEST TROUBLE IS SOLVED ONCE YOU EAT IT IN THE MORNING.

IF IT'S YOUR JOB TO EAT TWO FROGS, EAT THE BIGGEST ONE FIRST.

LAMMPS 未分类指令集

compute heat/flux command compute ID group-ID heat/flux ke-ID pe-ID stress-ID ID, group-ID are documented in compute command 1. heat/flux = style name of this compute command 1. ke-ID = ID of a co...

Posted by XiLock on January 16, 2021

LAMMPS 分组group

ID为10、25、50以及500到1000（含）: group sub id 10 25 50 500:1000 原子id≤50: group sub id <= 150 MoleculeIdentifier在50到250之间（含）: group polyA molecule <> 50 250 include style with its arg mol...

Posted by XiLock on January 16, 2021

LAMMPS 氢键计算

参考资料: 如何将lammps轨迹文件导入VMD统计氢键

Posted by XiLock on January 16, 2021

LAMMPS NEMD

；参考资料【计算】用非平衡态方法采用lammps计算“合金体系”的热导率 fix thermal/conductivity

Posted by XiLock on January 15, 2021

Linux 远程控制

远程软件 MobaXterm 免费版的就够用。 VNC的时候如果报错：“No configured security type is supported by 3.3 viewer”，则把远程机器的RealVNC的encryption选项选为prefer on，同时远端机器的VNC认证方式从windows认证改成了vnc认证。 Xshell/Xftp 连接通过账号密码...

Posted by XiLock on January 15, 2021

LAMMPS DPD

；参考资料理论：Mesoscopic simulations of molten silicates using the LAMMPS code 实例：Practicing DPD with LAMMPS lammps/example/USER/dpd

Posted by XiLock on January 14, 2021

发现问题·分析问题·解决问题

发现问题，分析问题，解决问题用图形对“发现问题，分析问题，解决问题”进行建模立方体：创作空间中心点：我散落在空间内的蓝色点：待发现的问题从我们自身向外发射出射线，当射线撞到问题点的时候，我们就发现了问题射线能撞到多少个点，取决于发现问题的能力橙色射线的韧性，是分析问题的能力同时，我们掌握的技术也存在于空间之内（绿色点），有的技术体积较...

Posted by XiLock on January 13, 2021

MS CASTEP

即便不报错，也要注意看Warning！！！** **即便不报错，也要注意看Warning！！！ *即便不报错，也要注意看Warning！！！密度泛函理论 Kohn-Sham方程定理1：多电子体系的基态总能量是电子密度的唯一函数。定理2：电子密度确定，体系的基态性质就唯一确定。电子运动状态–>电子密度分布状态。初始状态–>生成KS势–>求解K...

Posted by XiLock on January 12, 2021

LAMMPS reaxff

简介 ReaxFF反应力场适用于各类化学反应体系的模拟，特别是原理简单、动态复杂的反应/过程。利用合适的工具和工作方法，我们可以实现一定程度上的“虚拟实验”，得到一些实验室里无法得到的信息，例如燃烧、爆炸、分解反应的历程、连续复杂过程中物质的相互转化等。因为是多体势，运行的速度直接和密度相关，分子越大、越密集，产生的pair就越多，越慢。使用16核，5000原子左右的体系，0.2...

Posted by XiLock on January 11, 2021

LAMMPS 模量

概念应变应力弹性模量 Elastic modulus 杨氏模量E(Young’s modulus,又称拉伸模量,tensile modulus)：衡量一个各项同性弹性体的刚度（stiffness），定义为在胡克定律适用的范围内，单轴应力(tensile stress)和单轴形变(tensile strain)之间的比。体积模量K(bulk modulus) 剪切模量...

Posted by XiLock on January 11, 2021