神探玺洛克的厨房

如果有天堂，一定是一半厨房，一半书房，然后在书房里还有一张床。

Nice cook, nice book, nice food, nice mood. One bed, no bad

------XiLock

SOME WORKS IS LIKE A FROG, YOU WON'T WANT TO EAT IT AS IT'S DISGUSTING.

THE BIGGEST TROUBLE IS SOLVED ONCE YOU EAT IT IN THE MORNING.

IF IT'S YOUR JOB TO EAT TWO FROGS, EAT THE BIGGEST ONE FIRST.

2019-每周补脑7th

它山之石不必抓住每一分钟去自律，而是要抓住自律的每一分钟。蓝斯登原则：在你往上爬的时候，一定要保持梯子的整洁，否则你下来时可能会滑倒。（进退有度，才不至于进退维谷；宠辱皆忘，方可以宠辱不惊。）卢维斯定力：谦虚不是把自己想得很糟，而是完全不想自己。（如果把自己想得太好，就容易将别人想得很糟。）斯坦纳定力：在哪里说的愈少，在那里听到的就愈多。花半秒钟就看透事物本质...

Posted by XiLock on March 23, 2019

DAQ信号采集-Labview/Matlab

Labview客服 Labview有问题可以给售后发邮件： If you have technical inquiries in the future, feel free to drop us an email at “ asean.anz.support@ni.com “. We will be happy to assist you. Next time you need to c...

Posted by XiLock on March 18, 2019

Linux Module使用说明

参考资料： Modules环境模块管理工具简介 Environment Modules软件包以模块为单位，为用户动态设置Linux或UNIX的环境变量的软件。模块的概念，“应用名”和“应用的版本”的二元组，即一个模块对应的是一个特定版本的应用。 Environment Modules软件包独立于具体使用的Shell，支持多种主流的Shell。最新版本:2012.12发布的mo...

Posted by XiLock on February 24, 2019

Gromacs问题 Q&A

Google找不到可以在这个mail box里找一下，里面有很多相关的提问和回答：mail-archive 遇到过的问题 … no domain decomposition for 20 ranks… Fatal error: There is no domain decomposition for 20 ranks that is compatible with the given bo...

Posted by XiLock on February 10, 2019

gmx Gromacs带上下wall的xy周期

带上、下壁面的xy周期体系在mdp中将周期部分修改为： pbc = xy ; 2-D PBC nwall = 2 wall-atomtype = CG321 CG321 wall-type = 9-3 wall-density = 4.6 4.6 wall-ewald-zfac = 3 wall-r-linpot = 0.01 ewald-geometry =...

Posted by XiLock on February 10, 2019

gmx Gromacs坐标固定

坐标约束坐标的restrain、freeze和constraint （参考自sobereva）gromacs有三种限制坐标的方式：限制（restrain）、冻结（freeze）、约束(constraint)。冻结和约束是完全去掉体系某些自由度，而限制则只是让某些自由度的运动受限。限制（restrain）：一般是用谐振势将某些原子间距离、分子中某些内坐标、或者某些原子的笛卡尔坐标系...

Posted by XiLock on February 10, 2019

gmx Gromacs小技巧

备注关于限制一般能量极小化的时候用-DFLEXIBLE使用柔性水，第一次动力学模拟时用-DPOSRES让蛋白质位置限制住，等水已经弛豫了，再去掉蛋白质的限制做动力学。只要动力学用2fs步长，都应当用constraint=hbonds 关于技巧续算一、意外中断的任务md1 gmx mdrun -v -deffnm md1 -cpi md1.cpt 二、md1已跑完，延续之前的模...

Posted by XiLock on February 10, 2019

化工人吃元宵的正确姿势

扫描文末二维码，关注这个学化工的厨子。每周六下午六点，公众号内定时发布欢迎将文章分享到朋友圈文/神探玺洛克一眨眼过完年已经十几天了，下周就是“元宵节”！！！古人称”夜”为“宵”，而正月又是农历的元月，所以人们把正月十五这第一个月圆之夜称为元宵节。据传，西汉时人们就开始过元宵节，汉武帝正月上辛夜在甘泉宫祭祀“太一”的活动。在汉魏之后，正月十五元宵节渐渐成为一个民俗节日。正月...

Posted by XiLock on February 9, 2019

不再联系，曾并肩的兄弟

扫描文末二维码，关注这个学化工的厨子。每周六下午六点，公众号内定时发布欢迎将文章分享到朋友圈文/神探玺洛克己亥年正月初二食鸡思雁作兄弟及冠落四方，纵使逢年不得觞。寝眠寐返同欢悦，斜枕失梦复寒凉。梅花夜开属五瓣，冬雪未曾一叉藏。才思脊令相并影，又念鸿雁成数行。 ——《一个学化工的厨子爱上推理》他错过了唯一一次看他拿出戒指向新娘求婚的机会，错过了唯一一次给他当伴郎的机会，...

Posted by XiLock on February 9, 2019

PBS排队系统&NSCC

PBS脚本文件 PBS脚本文件由脚本选项和运行脚本两部分组成。 PBS作业脚本选项（若无-C选项，则每项前面加‘#PBS’） -a date_time ： date_time格式为：[[[[CC]YY]MM]DD]hhmm[.SS] 表示经过date_time时间后作业才可以运行。 -c interval ：定义作业的检查点间隔，如果机器不支持检查点，则忽略此选项。 -C ...

Posted by XiLock on February 8, 2019